Hace cincuenta años, horribles criaturas apodadas como los "enemigos de la humanidad" aparecieron repentinamente en todo el mundo. Para combatir estas amenazas, los adolescentes dotados de habilidades sobrenaturales llamadas "Talentos", como la piroquinesis y el viaje en el tiempo, perfeccionan sus poderes en una academia en una isla apartada. Sin embargo, Nanao Nakajima es bastante diferente de los demás en la isla: no tiene talento. Con muchos adolescentes "talentosos" a su alrededor, Nanao suele ser objeto de acoso, pero aun así, todavía se esfuerza por completar su formación. Poco después, dos estudiantes transferidos, el misterioso Kyouya Onodera y la lectora de mentes Nana Hiiragi, se unen a la clase. Pero justo cuando todos comienzan a mezclarse como camaradas de armas, misteriosas desapariciones comienzan a amenazar toda la base de la clase.