Segunda temporada de Natsume Yuujinchou. Al igual que con su precuela, Zoku Natsume Yuujinchou trata sobre Takashi Natsume, un niño que ha tenido la habilidad de ver youkai desde que era joven, y su guardaespaldas youkai Madara, apodado Nyanko-sensei. Natsume intenta devolver los nombres escritos en su "Libro de amigos" (que heredó de su abuela Reiko) a los youkai de su aldea. A lo largo de estas aventuras, se encuentra con algunos youkai que son amigables, algunos que quieren robar el Libro y otros que quieren matarlo, mientras Natsume aprende sobre sí mismo y su relación con estos seres misteriosos en el camino.